Si al instalar Exchange Server 2007 SP1 el proceso de instalación se detiene con el error 3221684229 al estar instalando el rol de Mailbox, esto se debe porqué la instalación se está efectuando en un equipo que tiene instalado Windows 2008 R2; sistema operativo que no es soportado.
Lo más recomendado es instalar el servidor nuevamente con Windows 2008 SP2, sin embargo podrias modificar las propiedades de compatibilidad del ejecutable setup.exe para que el proceso de instalación concluya sin problema.
0 on: "Error Code 3221684229 - Instalando Exchange 2007 SP1"